Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy3Q9D394 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rufy3Q9D394 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms