Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tssk3Q9D2E1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tssk3Q9D2E1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms