Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krtap5-3Q9D226 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krtap5-3Q9D226 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms