Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nol3Q9D1X0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms