Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed3Q9D0L1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed3Q9D0L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed3Q9D0L1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms