Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pbdc1Q9D0B6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pbdc1Q9D0B6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms