Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf146Q9CZW6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnf146Q9CZW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnf146Q9CZW6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms