Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1b1Q9CZS1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aldh1b1Q9CZS1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh1b1Q9CZS1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms