Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc18Q9CZJ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnajc18Q9CZJ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms