Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prelid3bQ9CYY7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prelid3bQ9CYY7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms