Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrs1Q9CYH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrs1Q9CYH6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrs1Q9CYH6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.8 ms