Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39aQ9CYC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem39aQ9CYC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms