Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis12Q9CY25 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mis12Q9CY25 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms