Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms