Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl11Q9CXW4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl11Q9CXW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms