Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nip7Q9CXK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nip7Q9CXK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nip7Q9CXK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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