Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RpainQ9CWY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RpainQ9CWY9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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