Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms