Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sft2d3Q9CSV6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms