Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9CRW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms