Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vta1Q9CR26 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vta1Q9CR26 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms