Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr3kQ9CQZ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms