Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg12Q9CQY1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms