Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ykt6Q9CQW1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms