Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim8Q9CQQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim8Q9CQQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim8Q9CQQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms