Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rwdd1Q9CQK7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rwdd1Q9CQK7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms