Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RTRAFQ9CQE8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTRAFQ9CQE8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms