Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ergic3Q9CQE7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ergic3Q9CQE7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms