Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700129C05RikQ9CQ77 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700129C05RikQ9CQ77 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms