Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl49Q9CQ40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl49Q9CQ40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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