Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnaseh2cQ9CQ18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms