Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska1Q9CPV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ska1Q9CPV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms