Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Npm3Q9CPP0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Npm3Q9CPP0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms