Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt23Q99PS0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt23Q99PS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt23Q99PS0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms