Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim12aQ99PQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim12aQ99PQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim12aQ99PQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms