Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubxn6Q99PL6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ubxn6Q99PL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms