Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GpnmbQ99P91 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GpnmbQ99P91 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms