Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rims1Q99NE5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rims1Q99NE5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rims1Q99NE5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rims1Q99NE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms