Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcgf6Q99NA9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pcgf6Q99NA9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms