Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cadm3Q99N28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cadm3Q99N28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms