Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd1Q99MV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd1Q99MV1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms