Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrrtQ99MR6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrrtQ99MR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms