Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnaja3Q99M87 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnaja3Q99M87 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms