Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gins4Q99LZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gins4Q99LZ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gins4Q99LZ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms