Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm3Q99LJ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm3Q99LJ5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm3Q99LJ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms