Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms