Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clp1Q99LI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clp1Q99LI9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clp1Q99LI9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms