Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp16Q99LG0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp16Q99LG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp16Q99LG0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms