Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RtcbQ99LF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RtcbQ99LF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RtcbQ99LF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms