Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcf2Q99LE6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcf2Q99LE6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcf2Q99LE6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms